Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MVB12AQ96EY5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MVB12AQ96EY5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms