Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCC1Q96CN9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms