Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR2Q969E8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms