Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CELF1Q92879 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms