Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF4BQ92750 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF4BQ92750 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms