Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPRUQ92729 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRUQ92729 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms