Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RGP1Q92546 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RGP1Q92546 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms