Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAPGEF4Q8WZA2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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