Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DNAJA4Q8WW22 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms