Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM41Q8WV44 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRIM41Q8WV44 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms