Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DCAF4Q8WV16 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF4Q8WV16 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms