Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX54Q8TDD1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDX54Q8TDD1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms