Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NUP35Q8NFH5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms