Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PIK3C3Q8NEB9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PIK3C3Q8NEB9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms