Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC155Q8N6L0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms