Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NME8Q8N427 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NME8Q8N427 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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