Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A9Q8IVB4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms