Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD163Q86VB7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms