Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT27Q7Z3Y8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT27Q7Z3Y8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms