Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRINP3Q76B58 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRINP3Q76B58 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms