Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP50Q70EL3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP50Q70EL3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms