Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TPGS1Q6ZTW0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms