Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBR3Q6ZT12 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBR3Q6ZT12 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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