Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRRC9Q6ZRR7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
LRRC9Q6ZRR7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms