Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SYNE3Q6ZMZ3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYNE3Q6ZMZ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms