Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPOCD1Q6ZMY3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms