Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFCAB12Q6NXP0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EFCAB12Q6NXP0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms