Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF544Q6NX49 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF544Q6NX49 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms