Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
REEP3Q6NUK4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
REEP3Q6NUK4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms