Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPH2Q6IBW4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NCAPH2Q6IBW4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms