Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTP1Q6DN14 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCTP1Q6DN14 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms