Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
INTS3Q68E01 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INTS3Q68E01 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms