Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HABP4Q5JVS0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HABP4Q5JVS0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms