Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC38Q502W7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC38Q502W7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms