Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTXN3Q4LDR2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms