Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LONRF3Q496Y0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms