Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC57Q2TAC2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC57Q2TAC2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms