Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GEN1Q17RS7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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GEN1Q17RS7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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GEN1Q17RS7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GEN1Q17RS7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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