Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCAQ16586 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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SGCAQ16586 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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SGCAQ16586 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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SGCAQ16586 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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SGCAQ16586 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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SGCAQ16586 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCAQ16586 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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