Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIK5Q16478 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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