Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TNXAQ16473 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TNXAQ16473 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNXAQ16473 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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