Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZIC1Q15915 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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