Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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SS18Q15532 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SS18Q15532 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SS18Q15532 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SS18Q15532 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SS18Q15532 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SS18Q15532 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SS18Q15532 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SS18Q15532 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SS18Q15532 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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