Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
IRF4Q15306 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF4Q15306 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms