Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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BRD3Q15059 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
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BRD3Q15059 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
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BRD3Q15059 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRD3Q15059 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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