Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF6Q15052 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF6Q15052 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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