Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
R3HDM1Q15032 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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