Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC7Q15024 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC7Q15024 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC7Q15024 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC7Q15024 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC7Q15024 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC7Q15024 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC7Q15024 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC7Q15024 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EXOSC7Q15024 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms