Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPSQ13938 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPSQ13938 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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