Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD1Q13562 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
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